Dejvid (12), Petar (10) i Alisa Lidlton (8) uživaju u idiličnom detinjstvu u Engleskoj krajem 19. veka. Oni najviše vole da se igraju u svojoj bašti i obližnjoj šumi, a dečiju živopisnu maštu podstiču roditelji Džek (Dejvid Ojelovo) i Rouz (Andželina Džoli).

Alisa i Petar su zaljubljeni u svog starijeg brata Dejvida, koji svoju pažnju deli na sestrine čajanke sa plišanim igračkama i uzbudljive gusarske avanture sa mlađim bratom. Njihov svet će biti poljuljan kada Rouzina sestra Elenor (Ana Čenselor), opseduta statusom, obezbedi Dejvidu mesto u Bristlmosu, prestižnom internatu, što znači da će Dejvid uskoro otići od kuće. Ali, zamišljeni života bez Dejvida postaje još gora stvarnost kada se dogodi tragedija – tokom igre na trošnom rečnom čamcu sa Petrom, Dejvid se oklizne i udavi.

Tuga preti da slomi porodicu Lidlton. Rouz se povlači u sebe, dosta pije, dok opsesivno pravi šešir od filca koji je obećala Dejvidu kao poklon za odlazak. Džek, majstor koji pravi makete brodova, ponovo upada u svoju zavisnost od kockanja i baca se u dugove, povezujući se sa svojom mračnom prošlošću podzemlja. Alisa u početku odbija da prihvati da Dejvida zaista nema i, odgurnuta od majke, približava se tetki koja odlučuje da je pretvori u pravu damu. U međuvremenu, Petar sebe krivi za Dejvidovu smrt i trudi se da popuni rupu koja je u porodici nastala zbog bratovljeve smrti.

Kako se situacija Lidltonovih pogoršava, i Petar i Alisa pronalaze snagu u moći svoje mašte i kreću u pravu avanturu kako bi spasili porodicu od besparice – avanturu koja ih vodi duboko u podle ulice viktorijanskog Londona, gde spoznaju neverovatna otkrića o poreklu svog oca.

Ohrabren, Petar shvata da nije rešenje da postane kao njegov stariji brat i odlučuje da pobegne u večno dečaštvo na daleko ostrvo Nedođija. U međuvremenu, Alisa se upušta u svet sopstvenog stvaranja, nazvan Zemlja čuda, gde shvata da se na kraju mora vratiti u stvarnost, odrasti i napraviti sopstveni izbor, između majke i tetke.

Tako se iz jedne tragične stvarnosti rađaju dve veoma različite fantastične legende: Petar Pan i Alisa u zemlji čuda.